Peter Parker lida com um simbionte alienígena que o torna agressivo; enfrenta o retorno de Harry Osborn como Novo Duende; e o surgimento de Flint Marko como Homem‑Areia após um experimento que deu errado. O filme explora a luta interna de Peter entre vingança e redenção, enquanto os três vilões se unem no clímax para ameaçar Nova York.